スペースシードホールディングス(東京都港区)と岐阜大学は、宇宙飛行前後で有意に変化した血液中遺伝子の発現を逆方向に変える可能性がある海藻由来成分を公開データから探索し、実験で優先検証する候補として8物質を抽出した。公開DBの照合・統合工程に生成AIを用い、3つのDBを横断して解析したという。
解析は海藻成分DB「SWMD」1,191件、化合物添加時の発現DB「CIGS」13,221化合物(遺伝子3,407)、宇宙飛行士6名の全血データ「NASA OSD-53(GEO: GSE47126)」を利用した。宇宙飛行の打ち上げ10日前と帰還直後を比較し、調整済みp値0.05未満の11遺伝子を抽出、うちCIGS側でも測定がある10遺伝子で評価した。
手法は化合物名を大文字化し英数字以外を除去したうえで文字列の完全一致のみを採用し、SWMDとCIGSで一致した15レコードを対象に、化合物添加時の発現変化方向が宇宙飛行時と逆になる遺伝子数を集計して順位付けした。最多はStigmasterolで、10遺伝子中7遺伝子が逆方向に動いたとしている(細胞はHEK293T)。抽出物質はApigenin、Cholesterol、Fucosterol、Fucoxanthin、Phytol、Protocatechualdehyde、Stigmasterol、Vanillin。
両者は今後、同一細胞株で濃度・処理時間依存性を確認し、qPCRやRNA-seqで10遺伝子を再測定して再現性を検証する方針だ。末梢血単核球や血管内皮細胞などでも検証対象を広げ、複数データセットでの一貫性や血液中の細胞組成変化の影響も評価するとしている。なお、今回の結果は探索的で、ヒトでの有効性・安全性や食品配合の可否を示すものではない。
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